Od svoje svetske premijere, serija “Čista hemija” je dobila brojne nagrade i nominacije, 165 Emi nagrada i 58 nominacija uključujući i nagradu za Najbolju dramsku seriju 2013. i 2014. Serija je osvojila i dve Pibodi nagrade, jednu 2008. i jednu 2013. godine. Za lik Valtera Vajta, Brajanu Krenstonu je dodeljen Prajmtajm Emi za najbolju mušku ulogu u seriji čak četiri puta (2008, 2009, 2010. i 2014).
“Čista hemija” je osvojila Emi za najbolju seriju 2014, iste godine kada joj je dodeljen i Zlatni Globus za najbolju televizijsku seriju, a Brajan Krenston za najbolje odglumljenu ulogu u televizijskoj seriji. Serija je ukupno osvojila 110 i bila nominovana za 262 nagrade.
Sa Brajanom Krenstonom, dobitnikom Zlatnog Globusa i Emi nagrade u glavnoj ulozi i dobitnicima Emija Aronom Paulom (Big Love) i Anom Gun (Deadwood), Dinom Norisom (Little Miss Sunshine), Betsi Brandt (CSI) i RJ Mit (Hannah Montana,Weeds).
